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Untersuchung der Wechselwirkungen nicht-kodierender RNA, die die Infektiosität des Coronavirus und die Immunabwehr beeinflussen
Übersicht
Coronaviren (CoVs) stellen nachweislich ein erhebliches Risiko für die menschliche Bevölkerung dar, wie das Auftreten hochpathogener Viren wie dem schweren akuten respiratorischen Syndrom Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) zeigt. Als obligat intrazelluläre Pathogene sind Viren vollständig von den zellulären Prozessen ihres Wirts abhängig. Daher ist die Erforschung der Wechselwirkungen zwischen Virus und Wirt unerlässlich, um die Mechanismen zu verstehen, die den viralen Replikationszyklus und alle mit einer Infektion verbundenen pathologischen Folgen regulieren. Bislang stammen die meisten unserer Erkenntnisse über die Wechselwirkungen zwischen Virus und Wirt aus der Untersuchung von Protein-Protein-Interaktionen. Fortschritte in der Sequenzierungstechnologie haben jedoch gezeigt, dass der Großteil des Genoms von Säugetieren durchgängig transkribiert wird und nur 2–3 % der Transkripte das Potenzial besitzen, Proteine zu kodieren. Die sogenannten nicht-kodierenden RNAs (ncRNAs) werden zunehmend als Teil verschiedener regulatorischer und zellulärer Prozesse, darunter auch der Wechselwirkungen zwischen Virus und Wirt, anerkannt und charakterisiert.
Das übergeordnete Ziel dieses Projektvorschlags besteht darin, die Rolle nicht-kodierender RNAs während der Coronavirus-Replikation und der Immunabwehr zu identifizieren und aufzuklären. Die Hervorhebung der Bedeutung von ncRNAs wird neue Möglichkeiten bieten, kritische Wechselwirkungen zwischen Viren und ihrem Wirt anzugehen, um Ziele für pharmazeutische Interventionen zu identifizieren. Wir gehen davon aus, dass ncRNAs einen erheblichen Einfluss auf die CoV-Infektion haben können, was zur Virusempfindlichkeit und Immunabwehr beitragen könnte.
Unsere Arbeitspakete (engl.: Work packages, WP):
WP1: Identifizierung von miRNAs als CoV-Restriktionsfaktoren
WP2: Charakterisierung von lncRNAs als Faktoren, die zur Immunabwehr gegen CoV beitragen
WP3: Funktionale Charakterisierung
WP4: Untersuchung spezifischer Lieferstrategien
Das Team
Prof. Dr. Stephanie Pfänder
Projektleiterin
E-Mail:
Telefon: +49 (0)40 48051-245
Forschungsgruppe Pfänder
Die Forschungsgruppe „Emerging Viruses“ hat ihren Sitz am Leibniz-Institut für Virologie (LIV).