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| Home > Departments > Center for Experimental Medicine > Department of Computational Neuroscience > Staff > Details Nils Forkert

Dipl.-Inf. Nils Daniel Forkert

Department of Computational Neurosience Center of Experimental Medicine University Medical Center Hamburg-Eppendorf Phone: ++49 (40) 7410-57792 Fax: ++49 (40) 7410-54882 E-Mail: n.forkert@uke.uni-hamburg.de

Publications

Journal Articles / Medline listed Articles:

1. Nils D. Forkert, Alexander Schmidt-Richberg, Brigitte Holst, Alexander Münchau, Heinz Handels, Kai Boelmans:
   Image-based Classification of Parkinsonian Syndromes Using T2'-Atlases
   Studies in Health Technology and Informatics 169, 465-469, 2011.
   
   
2. Götz Thomalla, Bastian Cheng, Martin Ebinger, Qing Hao, Thomas Tourdias, Ona Wu, Jong S. Kim, Lorenz Breuer, Oliver C. Singer, Stephen Warach, Soren Christensen, Andras Treszl, Nils D. Forkert, Ivana Galinovic, Michael Rosenkranz, Tobias Engelhorn, Martin Koehrmann, Matthias Endres, Dong-Wa Khang, Vincent Dousset, A. Gregory Sorensen, David S. Liebeskind, Jochen B. Fiebach, Jens Fiehler Christian Gerloff
   MRI identifies acute ischemic stroke patients within a time window for thrombolysis - a multicentre observational study on the predictive value of DWI-FLAIR mismatch for the identification of acute ischemic stroke patients #4.5 h of symptom onset (PRE-FLAIR)
   The Lancet Neurology 10(11), 978-986, 2011
   
   
3. Michael Groth, Nils D. Forkert, Jens Fiehler:
   Variability in Visual Assessment of Cerebral Aneurysms Could Be Reduced by Quantification of Recurrence Volumes
   American Journal of Neuroradiology 32(8), E163-4, 2011.
   
   
4. Dennis Säring, Jens Fiehler, Thorsten Ries, Nils D. Forkert
   Rigid 3D-3D Registration of TOF MRA Integrating Vessel Segmentation for Quantification of Recurrence Volumes after Coiling Cerebral Aneurysm
   Neuroradiology (accepted)
   
   
5. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Heinz Handels:
   Automatic Analysis of the Arteriovenous Malfomation Anatomy using 3D and 4D MRA image sequences
   Stud Health Technol Inform. 2010;160:1268-72.
   
   
6. Dennis Säring, Nils D. Forkert, Till Illies, Jens Fiehler, Heinz Handels:
   Evaluation of Methods for Determination of Bolus Arrival Time using a four-dimensional MRA Flow Phantom
   Stud Health Technol Inform. 2010;160:1263-7.
   
   
7. Nils D. Forkert, Alexander Schmidt-Richberg, Jens Fiehler, Till Illies, Dietmar Möller, Heinz Handels, Dennis Säring:
   Fuzzy-based Vascular Structure Enhancement in Time-of-Flight MRA Images for Improved Segmentation
   Methods of Information in Medicine, 50, 1, 74-83, 2011.
   
   
8. Thorsten Ries, Karl Wegscheider, Asmus Wulff, Kristin Radelfahr, Dennis Säring, Nils D. Forkert, Jens Fiehler
   Quantification of recurrence volumes after endovascular treatment of cerebral aneurysm as surrogate endpoint for treatment stability
   Neuroradiology 53(8), 593-598, 2011. 
   
   
9. Nils D. Forkert, Jens Fiehler, Thorsten Ries, Till Illies, Dietmar Möller, Heinz Handels, Dennis Säring:
   Reference Based Linear Curve Fitting for Bolus Arrival Time Estimation in 4D MRA and MR Perfusion-Weighted Image Sequences
   Magnetic Resonance in Medicine, 65, 1, 289-294, 2011.
   
   
10. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Matthias Färber, Till Illies, Jens Fiehler, Dietmar Möller, Heinz Handels:
    Automatic Brain Segmentation in Time-of-Flight MRA Images
    Methods of Information in Medicine 48(5), 399-407, 2009
    
    
11. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Karolin Wenzel, Till Illies, Jens Fiehler, Heinz Handels:
    Fuzzy-based extraction of vascular structures from TOF MRA images
    Studies in Health Technology and Informatics 150, 816-820, 2009
    
    
12. Jens Fiehler, Till Illies, Merle Piening, Dennis Säring, Nils D. Forkert, Ulrich Grzyska, Heinz Handels, James V. Byrne:
    Territorial and Microvascular Perfusion Impairment in Brain Arteriovenous Malformations
    American Journal of Neuroradiology, 30, Feb., 356-361, 2009.
    
    
13. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Jens Fiehler, Till Illies, Dietmar Möller, Heinz Handels:
    Automatische Lokalisation und hämodynamische Charakterisierung von Gefäßstrukturen bei arteriovenösen Malformationen
    Journal GMS Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie, 5, 3, Doc19, 2009.
          

Proceedings Articles:

1. Nils D. Forkert, Alexander Schmidt-Richberg, Alexander Münchau, Jens Fiehler, Heinz Handels, Kai Boelmans
   Automatische Atlas-basierte Differenzierung von Klassischen und Atypischen Parkinsonsyndromen
   Bildverarbeitung für die Medizin 2012, Berlin, 2012 (accepted).
   
   
2. Nils D. Forkert, Philipp Kaesemann, Jens Fiehler, Götz Thomalla:
   Comparison of TTP and Tmax estimation techniques in perfusion-weighted MR datasets for tissue-at-risk definition
   SPIE Medical Imaging 2012, San Diego, USA (accepted)
   
   
3. Tobias Verleger, Dennis Säring, Susanne Siemonsen, Jens Fiehler, Nils D. Forkert:
   Segmentierung rekanalisierter Blutgefäße nach Lysetherapie unter Verwendung von Time-of-Flight MRA Datensätzen
   Workshop Emerging Technologies for Medical Diagnosis and Therapy, 41. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Informatik (GI), 2011, Berlin, (accepted).
   
   
4. Nils D. Forkert, Alexander Schmidt-Richberg, Jan Ehrhardt, Jens Fiehler, Heinz Handels, Dennis Säring
   Vesselness-geführte Level-Set Segmentierung von zerebralen Gefäßen
   In: Handels H., Ehrhardt J., Deserno, T.M., Meinzer H.P., Tolxdorff T. (Hrsg.), Bildverarbeitung für die Medizin 2011, Informatik aktuell, Springer Verlag, Heidelberg, 8-12, 2011.
   
   
5. Nils D. Forkert, Dennis Saering, Till Illies, Jens Fiehler, Jan Ehrhardt, Heinz Handels, Alexander Schmidt-Richberg
   Direction-Dependent Level Set Segmentation of Cerebrovascular Structures
   In: Benoit M. Dawant, David R. Haynor (eds.), Image Processing, SPIE Medical Imaging 2011, Orlando, USA, Vol. 7962, 3S1-3S, 2011.
   
   
6. Nils D. Forkert, Till Illies, Milena Piening, Jens Fiehler, Heinz Handels, Dennis Säring:
   Perfusion Analysis in Cerebral Arteriovenous Malformations combining pASL and TOF Image Sequences
   International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 5, Supp. 1, 337-338, 2010
   
   
7. Nils D. Forkert, Alexander Schmidt-Richberg, Dennis Säring, Till Illies, Jens Fiehler, Dietmar Möller, Heinz Handels:.
   Graphen und Level-Set basierte Nachverarbeitung von Gefäßsegmentierungen
   In: Deserno, T.M., Handels H., Meinzer H.P., Tolxdorff T. (Hrsg.), Bildverarbeitung für die Medizin 2010, Informatik aktuell, Springer Verlag, Heidelberg, 425-429, 2010.
   
   
8. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Andrea Eisenbeis, Frank Leypold, Jens Fiehler, Heinz Handels:
   Experimental Assessment of Infarct Lesion Growth in Mice using Time Resolved T2* MR Image Sequences
   In: Deserno, T.M., Handels H., Meinzer H.P., Tolxdorff T. (Hrsg.), Bildverarbeitung für die Medizin 2010, Informatik aktuell, Springer Verlag, Heidelberg, 330-334, 2010.
   
   
9. Nils D. Forkert, Alexander Schmidt-Richberg, Dennis Säring, Till Illies, Jens Fiehler, Heinz Handels:
   Closing of Interrupted Vascular Segmentations: An Automatic Approach Based on Shortest Paths and Level Sets.
   Dawant B.M., Haynor D.R. (eds.), Image Processing, SPIE Medical Imaging 2010, San Diego, Vol. 7623, 3G1-3G8, 2010.
   
   
10. Heinz Handels, Nils D. Forkert, Dennis Säring, Till Illies, Jens Fiehler:
    Combined Analysis and 3D Visualization of Brain Vessel Topology and Cerebral Blood Flow in 3D and 4D MRA Image Sequences of Patients with Arteriovenous Malformations.
    Proceedings of the 12th Korea-Germany Joint Workshop on Advanced Medical Image Processing, 47-52, 2009
    
    
11. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Till Illies, Jens Fiehler, Heinz Handels:
    Comparison of Bolus Arrival Time Determination Methods for the Analysis of Cerebral Hemodynamics by Estimating the Impact of Temporal Resolution of 4D MRA Imaging
    In: Dössel O., Schlegel W.C. World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, WC 2009, Springer Verlag, Berlin, IFBME Proceedings 25/IV, 1174-1177, 2009.
    
    
12. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Jens Fiehler, Till Illies, Heinz Handels:
    AnToNIa: A Software Tool for the Hemodynamic Analysis of Cerebral Vascular Malformations Using 3D and 4D MRA Image Sequences.
    In: Fischer S., Maehle E., Reischuk R. (Hrsg.), Informatik 2009 - Im Fokus das Leben, Lecture Notes in Informatics, GI, Bonn, Vol. P-154, 1309-1316, 2009.
    
    
13. Nils D. Forkert:
    Analyse und dynamische 3D-Visualisierung des Blutflusses von zerebralen Gefäßstrukturen unter Verwendung von 3D- und 4D-Magnetresonanzangiographie-Bildfolgen
    In: Gesellschaft für Informatik (Hrsg.), Informatiktage 2009, Lecture Notes in Informatics, 223-226, 2009.
    
    
14. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Karolin Wenzel, Till Illies, Jens Fiehler, Dietmar Möller, Heinz Handels:
    Automatische Segmentierung der zerebralen Gefäße aus 3D-TOF-MRA-Bildsequenzen mittels Fuzzy-Methoden.
    In: Meinzer H.P., Deserno, T.M., Handels H., Tolxdorff T. (Hrsg.), Bildverarbeitung für die Medizin 2009, Informatik aktuell, Springer Verlag, Heidelberg, 46-51, 2009.
    
    
15. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Jens Fiehler, Till Illies, Dietmar Möller, Heinz Handels:
    Analysis and Dynamic 3D Visualization of Cerebral Blood Flow Combining 3D and 4D MR Image Sequences.
    In: Miga M.I.,Wong K.H. (eds.), Visualization, Image Guided Procedures, and Modeling, SPIE Medical Imaging 2009, Orlando, Vol. 7261, 331-338, 2009.
    
    
16. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Matthias Färber, Till Illies, Jens Fiehler, Dietmar P.F. Möller, Heinz Handels:
    Fullly Automatic Skull-Stripping in 3D Time-of-Flight MRA Image Sequences.
    In: Botha C.P., Kindlmann G., Niessen J., Preim B. (eds.), Eurographics Workshop on Visual Computing for Biomedicine, Eurographics Association, Delft, 159 -165, 2008.
    
    
17. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Matthias Färber, Till Illies, Jens Fiehler, Dietmar P.F. Möller, Heinz Handels:
    Automatische graphenbasierte Gehirnsegmentierung in hochauflösenden 3D-TOF-Magnetresonanzangiographien.
    In: Zöllner I., Klar R. (Hrsg.), Tagungsband der 53. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (GMDS), Stuttgart, 146-148, 2008.
    
    
18. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Till Illies, Jens Fiehler, Heinz Handels:
    Automatische Lokalisation und hämodynamische Charakterisierung von Gefäßstrukturen bei arteriovenösen Malformationen.
    In: Tolxdorff T., Braun J., Deserno, T.M., Handels H., Horsch A., Meinzer H.-P. (Hrsg.), Bildverarbeitung für die Medizin 2008, BVM 2008, Informatik aktuell, Springer Verlag, Berlin, 107-111, 2008.
    
    
19. Nils D. Forkert, Dennis Säring, Jan Ehrhardt, Jens Fiehler, Merle Piening, Heinz Handels:
    Analyse der Hämodynamik von zerebralen arteriovenösen Malformationen in 4D-MR-Bilddaten mittels referenzbasierter Kurvenpassung.
    41. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Biomedizinische Technik, Proceedings-CD BMT 2007, Biomedizinische Technik, Vol 52, Ergänzungsband, de Gruyter, Berlin, 2007.
    
    
20. Dennis Säring, Jens Fiehler, Nils D. Forkert, Merle Piening, Heinz Handels:
    Visualization and Analysis of Cerebral Arteriovenous Malformation Combining 3D and 4D MR Image Sequences.
    International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2, 75-79, 2007.
    
    
21. Dennis Säring, Jens Fiehler, Merle Piening, Nils D. Forkert, Heinz Handels:
    Visual Computing zur Analyse von zerebralen arteriovenösen Malformationen in 3D- und 4D-MR-Bilddaten,
    In: Horsch A., Deserno T.M., Handels H., Meinzer H.-P., Tolxdorff T. (Hrsg.), Bildverarbeitung für die Medizin 2007, BVM 2007, Informatik aktuell, Springer Verlag, Berlin, 262-266, 2007.
    

Abstracts:

1. Tobias Verleger, Dennis Säring, Michael Schönfeld, Susanne Siemonsen, Jens Fiehler, and Nils Daniel Forkert:
   Comparison of Rigid Registration Methods for Time-of-Flight MRA datasets
   Annual Meeting of the International Society for Magnetic Resonance in Medicine 2012, Melbourne, Australien, 2012 (accepted).
   
   
2. Susanne Siemonsen, Nils D. Forkert, Anne Hansen, Götz Thomalla, Jens Fiehler:
   Spatial distribution of MTT values in acute ischemic stroke
   European Stroke Conference 2011, Cerebrovascular Diseases 2011;31(suppl 2):92
   
   
3. Chressen Much, Jasmin Busch, Stephan Schlampp, Nils D. Forkert, Gerhard Adam, Christian Habermann
   Correlation between strength of paraspinal lumbar muscles, muscle degeneration and diffusion properties
   European Congress of Radiology, Vienna, 2012
   
   
4. Michael Schönfeld, Nils D. Forkert, Michael Groth, Jen-Hendrik Buhk, Jens Fiehler:
   View into aneurysm recurrences after coiling by a novel 3D display method
   46. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Neuroradiologie, Köln, 2011 (accepted)
   
   
5. Till Illies, Nils D. Forkert, Thorsten Ries, Jens Fiehler:
   Intranidal Flow and Morphological Characteristcs of Brain AVMs Evaluated By Colour-Coded 4D-MRA
   46. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Neuroradiologie, Köln, 2011 (accepted).
   
   
6. Till Illies, Nils D. Forkert, Dennis Säring, Jens Fiehler
   Flow Dynamics in Time Resolved MR Angiography in Brain AVMs at High Risk of Rupture.
   Annual Meeting of the Radiological Society of North America (RSNA) 2011.
   
   
7. Nils D. Forkert, Jan Sedlacik, Till Illies, Dennis Säring, Jens Fiehler:
   Comparison of 4D Magnetic Resonance Angiography Techniques and Application to Cerebrovascular Diseases
   Annual Meeting of the Radiological Society of North America (RSNA) 2011.
   
   
8. Susanne Siemonsen, Nils D. Forkert, Anne Hansen, Götz Thomalla, Jens Fiehler
   Spatial distribution of MTT values in acute ischemic stroke
   European Stroke Conference, Hamburg, 2011 (accepted)
   
   
9. Andrea Eisenbeis, Alexandra Gersing, Frank Leypoldt, Nils D. Forkert, Tim Magnus, Jens Fiehler
   Dynamics of early signal intensity changes in T2*-weighed imaging after middle cerebral artery occlusion (MCAO)
   Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Neuroradiologie 2010, Köln (accepted). 
   
   
10. Nils D. Forkert, Thorsten Ries, Karl Wegscheider, Dennis Säring, Jens Fiehler, Heinz Handels:
    Bildgestützte Quantifizierung von Aneurysmareperfusion zur Beurteilung des Behandlungserfolges von Coil-Therapien
    In: Schmücker P., Ellsässer K.H., Hayna S. (Hrsg.), Abstractband der 55. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (GMDS), Mannheim, 230-232, 2010.
    
    
11. Andrea Eisenbeis, Frank Leypoldt, Alexandra Gersing, Nils D. Forkert, Tim Magnus, Jens Fiehler
    Frühe zeitliche Dynamik von seriellen T2*-gewichteten MRT-Sequenzen als Prädiktor für Infarktgröße und Penumbra in einem Mausmodell des ischämischen Schlaganfalls
    Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Neuroradiologie 2010, Clin Neuroradiol, 20(3), 207, 2010
    
    
12. Nils D. Forkert, Thorsten Ries, Till Illies, Jens Fiehler, Heinz Handels, Dennis Säring
    Combination of 3D and 4D MRA Image Sequences for Improved Quantitative and Visual Rating of Cerebrovascular Malformations
    Annual Meeting of the Radiological Society of North America (RSNA) 2010 (accepted).
    
    
13. Thorsten Ries, Kristin Radelfahr, Dennis Säring, Nils D. Forkert, Jens Fiehler:
    The Recurrence Kink: A Natural Threshold for Aneurysm Retreatment?
    44. Jahrestagung der DGNR, Proceedings CD, 2009
    
    
14. Thorsten Ries, Kim Mouridsen, Kristin Radelfahr, Dennis Säring, Nils D. Forkert, Jens Fiehler:
    More Timely Evaluation of New Coils by Quantification of Aneurysm Recurrence Volumes
    44. Jahrestagung der DGNR, Proceedings CD, 2009
    
    
15. Thorsten Ries, Dennis Saering, Nils D. Forkert, Hermann Zeumer, Jens Fiehler:
    Visualization and quantification of aneurysm recurrences in rigid 3D-3D-co-registered MRA
    43. Jahrestagung der DGNR, Saarbrücken, Proceedings CD, 2008.
    
    
16. Till Illies, Nils D. Forkert, Dennis Säring, Karolin Wenzel, Jan Regelsberger, Manfred Westphal, Ulrich Grzyska, James Byrne, Jens Fiehler:
    Haemorrhage risk in brain arteriovenous malformations (AVMs) is related to delayed flow in deep venous structures
    43. Jahrestagung der DGNR, Saarbrücken, Proceedings CD, 2008
    
    
17. 5. Jens Fiehler, Till Illies, Milena Piening, Dennis Säring, Nils D. Forkert, Jan Regelsberger, Ulrich Grzyska, James Byrne:
    Two levels of perfusion impairment in brain arteriovenous malformations
    43. Jahrestagung der DGNR, Saarbrücken, Proceedings CD, 2008.
    
    
18. Till Illies, Nils D. Forkert, Dennis Säring, Jan Regelsberger, Manfred Westphal, Ulrich Grzyska, Jens Fiehler:
    Hemorrhage Risk in Brain Arteriovenous Malformations (AVMs) is related to High Flow in Deep Venous Structures
    Annual Meeting of the European Society of Neuroradiology (ESNR), Krakow, 2008
    Neuroradiology 2008; 50 (Suppl 1):68
    
    
19. Jens Fiehler, Till Illies, Dennis Säring, Nils D. Forkert, Jan Regelsberger, Ulrich Grzyska, Heinz Handels, James Byrne:
    Territorial and Microvascular Perfusion - The two Levels of Perfusion Impairment in Brain Arteriovenous Malformations
    Annual Meeting of the European Society of Neuroradiology (ESNR), Krakow, 2008
    Neuroradiology 2008; 50 (Suppl 1):68
    
    
20. Till Illies, Nils D. Forkert, Dennis Säring, Peter Horn, Ulrich Grzyska, Jens Fiehler:
    Perinidal Perfusion in Arteriovenous Malformations (AVMs) of the Brain,
    42. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Neuroradiologie, Clin Neuroradiol 2007; 17 (Spec Issue 1):26
    
    
21. Dennis Säring, Nils D. Forkert, Jens Fiehler, Merle Piening, Heinz Handels:
    Analyse des zerebralen Blutflusses bei arteriovenösen Malformationen unter Verwendung von 3D MRA und ASL Bilddaten
    52. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (GMDS), Augsburg, GMDS Abstractband 292-293, 2007.
    

Books:

1. Nils D. Forkert:
   Analyse der zerebralen Hämodynamik mittels MRA-Bildfolgen: Segmentierung und hämodynamische Analyse von zerebralen Gefäßstrukturen in räumlich-zeitlichen MRA-Bildfolgen
   VDM Verlag Dr. Müller, 2009.

Awards:

	Best Student Paper World Congress on Medical and Health Informatics (MedInfo) 2010
	Preis der Expo-Ausstellung des Departments Informatik, Universität Hamburg
	Honorable Mention Poster Award SPIE Medical Imaging 2009
	Preis für Medizin- und Biotechnologie an Hamburger Hochschulen
	GMDS-Förderpreis 2009 für den Bereich Medizinische Informatik