Die Liquorzytologie hat für die Fragestellung nach meningealer oder cerebraler Beteiligung bei hämatologischen Erkrankungen (Leukämien, Lymphome), bei Metastasen mit bekanntem oder unbekanntem Primärtumor sowie bei bildgebend unklaren primären Hirntumoren einen hohen Stellenwert. In vielen Fällen zeigen sich bereits aus der morphologischen Bewertung der Liquorzellen eindeutige Hinweise auf Malignität. Ergibt sich aus dem zytomorphologischen Befund nur ein Verdacht auf maligne Zellen, so ist eine immunzytochemische Charakterisierung der Zellen indiziert. Da die Phänotypisierung von Zellen meist nur über mehrere „Marker“ möglich ist, wird eine entsprechende Zahl von Zytopräparaten, die eine repräsentative Zahl von Zellen enthalten müssen, benötigt. In Abhängigkeit von der Fragestellung wird ein Antikörper-Grund-Panel gegen diagnostisch relevante Zelloberflächenantigene eingesetzt. Wichtige Leukozytendifferenzierungsmarker sind bei ALL (B-Typ) u.a. CD10, CD19, CD22, CD79a, HLA-DR, TdT und IgM, bei ALL (T-Typ) u.a. CD1a, CD2, CD3, CD5, CD7, CD10, TdT und TCR und bei AML u.a. CD13, CD14, CD33, CD34, CD64, CDw65, CD117, MPO und HLA-DR. Im Falle von B-Zell-Lymphomen wird die Expression von u.a. CD5, CD10, CD11c, CD19, CD20, CD38, IgM, Kappa und Lambda, bei T-Zell-Lymphomen u.a. CD1a, CD2, CD3, CD4, CD5, CD8 und TdT untersucht. Als Sreening-Marker bei Verdacht auf Metastasen von u.a. Karzinomen, Melanomen bzw. Zellen eines primären Hirntumors eignen sich Zytokeratin, EMA, Vimentin, CEA, NSE, S100, HMB45, GFAP, Neurofilament, CD45, HLA-DR und Ki67. Anhand von Fallbeispielen wird der Stellenwert der immunzytochemischen Phänotypisierung von malignen Zellen im Liquor cerebrospinalis dargestellt.