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Das Forschungsdekanat ist für Angelegenheiten der Forschung verantwortlich und wird durch den Fakultätsausschuss für Angelegenheiten der Forschung (FAF) beraten.
Primäre Aufgabe des Forschungsdekanates ist die Leistungserfassung der einzelnen Kliniken und Institute des UKE für die jährliche Erstellung eines Forschungsportfolio's und zur Darstellung im Forschungsbericht.
Zum Hauptaufgabenfeld zählen femer die Förderung und Beratung von Nachwuchswissenschaftlerinnen und Nachwuchswissenschaftlern sowie die Durchführung von Promotionen und Habilitationen. Das Informationsangebot umfasst die UKE-internen Forschungsförderungsprogramme als auch externe Förderungsoptionen, z. B. der DFG, des Landes, des Bundes und der Europäischen Union. Eines der nachhaltig erfolgreichsten Förderinstrumente innerhalb des UKE ist die Projektförderung für Nachwuchswissen-schaftlerinnen und Nachwuchswissenschaftler, die seit 2000 über ein internes Begutachtungsverfahren vergeben wird.
Eine zentrale Bedeutung nimmt auch die Betreuung und Beratung bei der Entwicklung von Forschungsschwerpunkten am UKE ein sowie die Förderung der etablierten Schwerpunkte.
Weitere Aufgaben sind die leistungsabhängige Mittel- und Raumvergabe im Bereich Forschung und die Koordinierung der gemeinsamen Nutzung der Großgeräte.
Der Internationale wissenschaftiche Austausch nimmt eine besondere Rolle im Aufgabenspektrum des Forschungsdekanates ein.